En 1243, Uri prend une initiative significative en adoptant un sceau commun, symbolisant une unité régionale croissante. En 1274, cette initiative est formellement reconnue par l'empereur Rodolphe Ier, marquant un tournant dans la légitimité de la région et de ses aspirations à l'autonomie.

Au XVIe siècle, Uri résiste à la Réforme et maintient sa foi catholique. Durant la République helvétique (1798-1803), il est intégré au canton de Waldstätten mais retrouve son indépendance après l'acte de médiation. Uri devient le bastion de la résistance contre les réformes religieuses et constitutionnelles, rejoignant la ligue de Sarnen en 1815. En 1845, il fait partie du Sonderbund, une ligue catholique séparatiste défaite par la Confédération suisse en 1847, marquant la fin de cette période tumultueuse.